Rome University, La Sapienza
Chemistry Department
Rome, Italy, Europe
Dr. Giovanni Visco
Cenni di statistica di base. Calcoli di regressioni e correlazioni
dicembre 2006
Corso di Laurea in: Scienze Applicate ai Beni Culturali ed alla Diagnostica per la loro Conservazione
Corso di laurea in: Chimica Ambientale
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Friedman test

  Cosa c'entra il famoso economista Milton Friedman (1912-2006), fra l'altro premio nobel nel 1976, con i test statistici? Avete dimenticato che la statistica ed il campionamento nascono nelle scienze sociali? R.A. Fisher la applicava alla eugenetica, W. Gosset la usava nel suo lavoro, uno dei primi software e' stato SPSS.

  Tornando al test, possiamo utilizzarlo per confrontare se piu' di 2 strumenti/operatori/metodi applicati agli stessi "oggetti" forniscono gli stessi risultati tanto da poter sostituire uno con un altro.

  Su questo test non c'e' confusione essendo stato scritto da una sola persona e ben descritto in tre articoli, nel 1937 (The Use of Ranks to Avoid the Assumption of Normality Implicit in the Analysis of Variance), una correzione nel nel 1939 (A Correction: The Use of Ranks to Avoid ....) e nel 1940 (A comparison of alternative tests of significance for the problem of m rankings).

  Un archivio librario, usiamo tre differenti sistemi per controllare l'umidita', posizioniamo questi tre sensori molto vicini fra loro e misuriamo per 15 giorni, alla matrice ottenuta possiamo applicare questo test. Bisogna far attenzione che dato un "oggetto" questo sia misurato nelle stesse condizioni in tutte e tre le prove. Pensate al caso di tre farmaci per la cura di YxYxx, li diamo alla stesse persone? E se confrontiamo quattro professori?

  Questo test puo' essere utilizzato con variabili almeno Ordinali, per distribuzioni abbastanza diverse dalla Gaussiana, con misure fatte in tempi diversi con "risoluzioni" diverse.

Il data set: provette del 2008, le prove per scegliere quale strumento usare, un solo operatore
Strumento, Provetta n. --> I II III IV V VI VII VIII IX X XI
Vernier micrometer, B 14.84 14.81 14.84 14.84 14.75 14.80 14.74 14.86 14.83 14.72 14.73
Vernier micrometer, A 14.85 14.82 14.84 14.83 14.78 14.85 14.76 14.86 14.85 14.74 14.76
Digital micrometer 14.808 14.798 14.809 14.827 14.750 14.824 14.758 14.836 14.846 14.720 14.751

  Gli strumenti sono: Toolmex Polmach, 50-100-025N, vernier micrometer, 0-25 mm, 0.01 mm, A=usato, B=nuovo; Mitutoyo, mod. 293812, MDC lite micrometer, 0-25 mm, 0.001 mm.

  Ormai il data set non necessita di una descrizione. Gli oggetti sono le famose provette da centrifuga e misuriamo il diametro a 10 mm dal fondo con tre micrometro che forniscono, due identici, una risoluzione di 0.01 mm, ed il terzo di 0.001 mm. Un solo operatore addestrato.

Definizioni:

  Nell'articolo originale M. Friedman non dava una sigla per il test, vari autori lo citano come χr2 , oppure come Q , od anche come T1 (senza dimenticare T2 se si vuol usare la distribuzione di Fisher per trvare la significativita').

hippo-L
items microm. B microm. A microm. Digit. rank B rank A rank D
I 14.84 14.85 14.808 2 3 1
II 14.81 14.82 14.798 2 3 1
III 14.84 14.84 14.809 2.5 2.5 1
IV 14.84 14.83 14.827 3 2 1
V 14.75 14.78 14.750 1.5 3 1.5
VI 14.80 14.85 14.824 1 3 2
VII 14.74 14.76 14.758 1 3 2
VIII 14.86 14.86 14.836 2.5 2.5 1
IX 14.83 14.85 14.846 1 3 2
X 14.72 14.74 14.720 1.5 3 1.5
XI 14.73 14.76 14.751 1 3 2
      Σri 19 31 16
      average 1.727 2.818 1.455
      (22-Σri)2 9 81 36

Calcoli:

  Per prima cosa costruiamo una tabella da 7 colonne, la prima e' il nome dell'items, la seconda/terza/quarta sono i valori misurati per il gruppo A/B/D nell'ordine. Le altre due sono i ranks.

  Particolarita' del test e' il calcolo dei ranks "di riga" cioe' fra i gruppi con il solito metodo anche per i ties. Controllate che la somma totale sia pari alla formula qui sotto.

summ of ranks summ of avg
la somma di tutti i ranks e la loro media aritmetica

  Gia' guardando i risultati si nota qualche differenza: il valore atteso per la somma dei rank di gruppo sarebbe 3*((11*(3+1))/2)= 3*22 = 66 e la media attesa dovrebbe essere (3+1)/2 = 2.

  Sembra che l'ipotesi H0 non sia rispettata! ma per controllare che questo non sia dovuto al caso bisogna confrontare il risultato con una distribuzione note ed ottenere la significativita'. Qui iniziano i problemi, l'autore nel suo lavoro cita χ2 ma qualche anno dopo anche F di Fisher.

F di Fisher
F di Fisher, piccoli campioni, n*k<35

Determining significance

  Se stiamo nel caso n*k<35 usiamo la F di Fisher con la formula gia' vista ed otteniamo nell'esempio visto Fr=126. Ove fossimo invece nel caso n*k>40 sarebbe meglio usare per i calcoli χr2e per le tabelle di significativita' il χ2.

  Nel nostro caso, con Fr, data l'ipotesi H0 che non vi sia differenza fra i gruppi ora dobbiamo calcolare quanto e' significativo il valore trovato. Come al solito i valori di significativa' sono al 90%, al 95%, al 99% a seconda di quanto accettiamo di errore sulla H0.

  Una tabella con i valori di Fisher la trovate su questo .pdf del Prof. L. Soliani, a pagina 60/61 (c'e' anche una bella descrizione). Oppure la trovate qui se non e' raggiungibile. Per l'esercizio vediamo che per k=3, n=11, il 95% di confidenza ha come limite 72, ma noi otteniamo 126. L'ipotesi H0 e' rifiutata.

hippo-L

  Sono disponibili almeno due calcolatori-on-line per il Friedman test. Come al solito sul Vassar College: Friedman k=3, et Friedman k=4 (ma queste pagine hanno qualche problemino di calcolo con alcuni browser, non e' colpa mia!). Un altro calcolatore online lo trovate qui, ma e' ancora peggio sui vari browser.

n=11, Friedman test
Il valore di p=0.0033 mostra che la H0 sarebbe rispettata se scegliessimo
lo 0.3% di confidenza e non come al solito il 95% o il 99%

  Fate attenzione alla scritta "Mean Ranks for Sample" qui sopra, se avete letto i vari link scoprite che questo calcolatore on-line usa χ2 e non Fr per il calcolo della significativita' !!

  Aggiungiamo un link ad un altra descrizione del test in questione, del NIST.

hippo-L
Cochran test
Friedman test chart

  Non e' lo scopo di queste slide di enumerare e spiegare tutti i test di correlazione (e poi prima di scrivere di una cosa bisognerebbe conoscerla!), percio' a chi e' interessato a questo test ecco un altro link.

  Ma allora bisogna citare anche un altro test molto simile, quello descritto da William Gemmell Cochran (1909-1980).

  Come al solito il grafico che si puo' produrre con questo test aiuta alla sua comprensione.

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